W badaniu histopatologicznym analizuje się pod mikroskopem materiał pobrany od pacjenta, aby ocenić charakter i stopień zaawansowania procesu chorobowego lub zmian, które nastąpiły w tkankach na skutek uszkodzenia ciała. Wyniki badania histopatologicznego są niezwykle pomocne także w diagnostyce pośmiertnej – na podstawie wycinka pobranego w trakcie sekcji zwłok można określić, np. czy uszkodzenie tkanek nastąpiło za życia czy po śmierci badanej osoby.